Strømsgodset vant 2-0 etter scoringer fra Jonas Therkelsen og Logi Tómasson.
Tabellfemmer FFK har imponert stort i comebacket på øverste nivå i norsk fotball, men i forsøket på å innta medaljeplass før søndagens eliteseriekamper måtte østfoldingene tåle et nederlag.
Lørdagens tap var Fredrikstads første siden 14. september.
Dermed har Brann, Molde og Viking muligheten til å øke avstanden til Fredrikstad før de fire siste kampene. Rosenborg kan med seier mot Bodø/Glimt mandag dytte FFK ned på 6.-plass.
Samtidig tok Godset et stort steg ut av den tette nedrykksstriden.